Les feuilles de moutarde peuvent être mangées crues ou cuites. Elles s'apprêtent comme l'épinard, qu'elles peuvent remplacer dans la plupart des recettes; leur saveur est plus forte cependant.
Les feuilles de moutarde sont délicieuses dans les soupes ou réduites en purée, surtout lorsqu'on les combine à de la purée de pommes de terre ou de légumineuses, ce qui atténue leur saveur piquante. Éviter de les cuire dans une casserole en aluminium ou en fer car elles noircissent au contact de ces métaux.
Les graines s'utilisent entières, moulues ou transformées en condiment; on en tire aussi une huile fortement aromatique. Entières, les graines peuvent être employées telles quelles ou rôties. En Inde, on les fait revenir dans de l'huile très chaude; elles éclatent alors à la manière du maïs soufflé (les cuire peu de temps car elles brûlent facilement et deviennent amères). On se sert des graines entières pour aromatiser une grande variété d'aliments, notamment marinades, légumineuses, sauces et currys.
La moutarde en poudre peut être ajoutée à de la vinaigrette ou à une mayonnaise; on s'en sert aussi pour assaisonner le jambon à cuire. On peut également la délayer pour en faire une pâte qui a un usage semblable à celui de la moutarde condiment. La moutarde condiment aromatise à peu près tout. Elle accompagne le lapin, le porc, le poulet et certains poissons gras avant leur cuisson. Elle est à la base de plusieurs sauces, chaudes ou froides: vinaigrette, mayonnaise, rémoulade, sauce à la diable, Robert ou Cambridge, entre autres.
La moutarde est appréciée depuis des millénaires comme condiment. Les Romains savaient la préparer et les Byzantins l'utilisaient pour relever leur vinaigrette; au Moyen Âge, elle était présente sur toutes les tables car elle permettait de déguster les viandes, salées pour les besoins de conservation.