Les matières grasses du lait de chèvre contiennent un peu moins de cholestérol que celles du lait de vache entier et les proportions d'acides gras sont sensiblement les mêmes. La meilleure digestibilité des matières grasses du lait de la chèvre s'expliquerait par la différence importante de composition de ses matières grasses et de celles du lait de vache. Les matières grasses du lait de chèvre présentent une plus forte teneur en acides gras à chaîne courte. Elles sont émulsifiées très finement, ce qui donne un caillé à texture très fine.
Le lait de chèvre est riche en potassium, en calcium et en phosphore; il est une bonne source de riboflavine et il contient de la vitamine A, du magnésium, de la niacine, de l'acide pantothénique, de la thiamine, du zinc, de la vitamine B12, de la vitamine B6 et du cuivre. L'enrichissement du lait de chèvre n'est pas obligatoire; par contre, s'il est fortifié, il doit contenir entre 35 et 45 UI de vitamine D et entre 140 et 300 UI de vitamine A par 100 ml, suivant la réglementation.