Frotter les crosses de fougère avec les mains pour les débarrasser de leurs écailles. On peut aussi les mettre dans un sac et les secouer. Les laver soigneusement, les assécher, puis les apprêter. Il est recommandé de ne les laver qu'au moment de les utiliser.
Les crosses de fougère contiennent parfois une toxine pouvant provoquer nausées, diarrhées et vomissements. Pour détruire cette toxine, il est impératif de laver les crosses de fougère à l'eau froide puis de les faire cuire pendant 10 à 12 min. L'eau de cuisson doit être jetée.
Éviter de surcuire les crosses de fougère ou d'ajouter du bicarbonate de sodium à l'eau de cuisson, car cela affecte leur couleur; ne pas s'étonner si l'eau de cuisson brunit. Pour la cuisson à l'eau, il est préférable qu'elle soit salée, la crosse de fougère aura bon goût si elle est cuite à point. La cuisson à la vapeur ou à l'étuvée donne aussi de très bons résultats.